Presencia de secuencias ERIC en Chlamydia trachomatis

Resumen

Introducción. Uno de los métodos empleados para la tipifi cación y el estudio de la diversidad genética bacteriana es la ERIC-PCR. La presencia de las secuencias consenso intergénicas repetitivas enterobacterianas (ERIC) se ha descrito en la mayoría de las bacterias Gram negativas, pero no se ha investigado su presencia en bacterias como Chlamydia trachomatis. Objetivo. Realizar la búsqueda in silico e in vitro de las secuencias ERIC en el genoma de Chlamydia trachomatis. Materiales y Métodos. En el estudio in silico, las secuencias ERIC se buscaron mediante la herramienta bioinformática FASTA y empleando los genomas de C. trachomatis D/uw-3/cx, C. trachomatis 434/Bu, C. trachomatis L2b/UCH-1/ proctitis, C. trachomatis A/har-13, C. muridarum Nigg, C. pneumoniae Tw-183, Aeromonas hydrophila y Escherichia coli K12, depositadas en la base de datos del NCBI. In vitro, se estandarizó la PCR empleando cepas de C. trachomatis serovariedades D, L2 y L3. Resultados. Se obtuvieron el número de alineamientos, la región de alineamiento de cada iniciador ERIC y los valores de expectación (E) y score (S) de cada genoma estudiado. Posteriormente, se determinó la presencia de la secuencias ERIC en las cepas de C. trachomatis serovariedades D, L2 y L3, siendo 44ºC la temperatura óptima de alineamiento en la PCR. Conclusiones. Con los resultados obtenidos, podemos sugerir que en el genoma de C. trachomatis existen las secuencias ERIC; si este hallazgo se reproduce en todas las serovariedades, se podría establecer un nuevo método de tipifi cación para esta bacteria.